PBR322 je plazmid koji ima dva restrikcijska mjesta za EcoRI dok T4 fag DNA ima tri restrikcijska mjesta za to. Ove dvije DNA su tretirane s EcoRI i puštene da teče na agaroznom gelu. Kakav će se uzorak dobiti na gelu?

PBR322 je plazmid koji ima dva restrikcijska mjesta za EcoRI dok T4 fag DNA ima tri restrikcijska mjesta za to. Ove dvije DNA su tretirane s EcoRI i puštene da teče na agaroznom gelu. Kakav će se uzorak dobiti na gelu?
Anonim

Odgovor:

Pitanje nije važeće, T4 ima oko 40 web-lokacija za EcoR1, a ne 3 …

pBR322 ima samo 1 mjesto za EcoR1, između gena faktora otpornosti AMP i TET-gena …

Obrazloženje:

Pregledi T4: (hvala, Springer Verlag!)

slika preuzeta s

© Springer-Verlag 1981

Ali, ako je vaše pitanje hipotetično:

i pBR322 i T4-genomi su kružni, tako:

pBR322: 2cuts = 2 fragmenta,

T4: 3 izreza = 3 fragmenta.

Trčeći na agaroznom gelu vidjet ćete 2 trake u pBR-laneu, 3 trake u T4-stazi, Bez obzira što su 2 ili više fragmenata jednake veličine ili blizu njih., U tom slučaju oni migriraju manje-više istom brzinom i neće se moći razlikovati. Relativni odnos G / C prema A / T također ima učinak.

Na kraju, ako su fragmenti u ovom hipotetičkom primjeru različiti po veličini, 2 benda za pBR, 3 za T4 …