Zašto se GAPDH koristi u Western Blotu? + Primjer

Zašto se GAPDH koristi u Western Blotu? + Primjer
Anonim

Odgovor:

GAPDH se često koristi kao kontrola punjenja.

Obrazloženje:

U Western blotingu često koristimo GAPDH kao kontrolu punjenja. To znači da sondiranjem GAPDH-a možemo provjeriti imamo li napunjene ekvivalentne količine proteina na različitim stazama blota.

Primjer uporabe - kažemo da imamo bolest za koju mislimo da uzrokuje povišenje određenog proteina u stanici. Napravili bismo uzorak od "zdravih" stanica i drugog uzorka iz "oboljelih" stanica. Tada bismo na gelu za Western blot učitali ekvivalentne količine proteina oba uzorka.

Nakon što smo probali blot za naš interesni protein, otkrili smo da je u bolesnim stanicama razina proteina doista povišena (to je tamniji pojas koji se stvara na blotu). Da bi se dokazalo da je ovo povećanje proteina posljedica promjene ekspresije u stanici, umjesto artefakta opterećenja (to jest, intenzivniji pojas uzrokovan je promjenom ekspresije proteina u stanicama, a ne slučajnim učitavanjem više "uzorka bolesti" od "zdravog") također bismo ispitali mrlju za GAPDH kako bismo pokazali da su ukupne razine proteina iste u obje trake.

Na taj način pokazujemo da je ekvivalentni protein napunjen u dvije trake i da je promjena intenziteta trake koju promatramo zbog promjena u ekspresiji proteina za interesni protein.