Zašto većina restrikcijskih enzima siječe palindromsku sekvencu?

Zašto većina restrikcijskih enzima siječe palindromsku sekvencu?
Anonim

Odgovor:

Zato što je učinkovitiji.

Obrazloženje:

Enzimi kao što su restrikcijski enzimi moraju prepoznati vrlo specifičan slijed kako bi izvršili svoj zadatak. Veže se na DNK samo u jednoj specifičnoj konfiguraciji. Srećom! jer ne želite "pacman" koji reže DNA na slučajnim mjestima.

DNA je dvolančana, tako da ima 'dvije strane' na koje se enzim može vezati. Palindromska sekvenca je ista unatrag i naprijed s obje strane (vidi sliku ispod). To znači da enzim prepoznaje slijed bez obzira s koje strane se enzim približava DNA.

Palindromska sekvenca također povećava šanse da se izrežu oba lanca DNA. Čak je moguće da dva enzima djeluju kao dimer za rezanje palindromske sekvence, što dodatno povećava učinkovitost.

Posljednji razlog bio je važan u borbi između virusa i bakterija. Bakterije su evoluirale kako bi "onesposobile" viruse koji ciljaju na bakterije (bakteriofage) pomoću restrikcijskih enzima koji se vežu za ove palindromske sekvence. Rezanje dviju niti DNA šteti virusu više nego rezanje jednog lanca.