Zašto se tijekom pročišćavanja proteina primjenjuju DNaza i lizozim u koracima lize?

Zašto se tijekom pročišćavanja proteina primjenjuju DNaza i lizozim u koracima lize?
Anonim

Odgovor:

Pročistiti frakciju proteina …

Obrazloženje:

Ako pročišćavate (često specifičan) protein, morat ćete se riješiti što više smeća koje bi mogle biti povezane s njima.

To u određenoj mjeri ovisi o tome koji protein tražite, ali općenito je to dobra ideja, posebno u pripremni pročišćavanje, da se riješi što je moguće više nečistoća.

1:

Kako su bjelančevine općenito velike i posljedično će se pojaviti u nižim trakama vaše (ultracentrifugirane) frakcije, želite se riješiti bilo kakvih nukleinskih kiselina, osobito ako se proteini koje ste proglasili odnosi na Pol1, Obrnuta transkriptaza ili bilo koji drugi enzim uključen u replikaciju / transkripciju / prevođenje.

Nukleinske kiseline prisutne u uzorku možete odvojiti pomoću DNAse: to će u potpunosti hidrolizirati DNA u sastavne dijelove.

Imajte na umu, postoje različiti DNK-ovi, koji se razlikuju u svom mehanizmu i specifičnosti za svoj supstrat. Ovisno o korištenom DNK, može se pokazati Endo- ili exo- aktivnost nukleacije …

Još važnije, RNAsom RNA je više prikladna, jer je RNA obično više unutar raspona uzgona / frakcija proteina, i može biti vezana za protein.

2:

lizozim: Enzim koji ima najmanje dvije funkcije:

To deglycosylates enzima: Većina proteina nošenih u krvotok su glikozilirani: oni imaju nekoliko molekula šećera na njih. Lizozim će ukloniti ostatke šećera.

Također ima sposobnost razbijanja stanične stijenke gram-pozitivnih bakterija, uzrokujući tako liziraj, (ako želite pročistiti protein iz gram-pozitivnih bakterija)

Svi degradirani proizvodi, bilo nukleinske kiseline ili ostaci šećera, pojavit će se na gornjim frakcijama Centrifugalne cijevi zbog njihove "lakše" uzgonosti.